En el Seminario de Tesis 2 se profundiza la investigación, analizando los datos recopilados, poniendo a prueba el planteamiento teórico y las hipótesis formuladas; y se procede a la redacción de la tesis, la que debe de haberse iniciado durante el seminario precedente. Prosigue la asesoría del coordinador de la especialidad y del profesor asignado como asesor en cuanto experto en el tema.
Si bien el seguimiento personalizado del trabajo de investigación es mucho más intenso, se mantienen las dinámicas grupales desarrolladas en los talleres intensivos y la articulación con los grupos de investigación, lo que permite continuar recibiendo aportes de otros docentes de la maestría.
Al finalizar el Seminario de Tesis 2 los alumnos deben de haber concluido la Tesis de Maestría y haberla puesto en discusión en el marco de los talleres intensivos. Una vez recibida la aprobación por parte de sus asesores, la tesis estará apta para su sustentación ante un jurado que incluirá profesores visitantes de la maestría.