En esta etapa los alumnos desarrollarán fundamentalmente su investigación de tesis con el apoyo de un asesor de tesis elegido por el programa. Si bien se prioriza el trabajo individualizado, a lo largo de cada semestre también se impartirán dos unidades de aprendizaje en las áreas especializadas del derecho de 9 horas lectivas cada una; a la vez que se llevarán a cabo sesiones para presentar los avances de los doctorandos.
Al final de cada semestre, el alumno debe presentar un capítulo de su tesis doctoral que recoja o de cuenta de los avances de su tema de tesis en la rama de especialización desde la que enfoca la investigación doctoral.